On n’entend plus trop parler d’Alise-Sainte-Reine au Moyen-âge mais elle n’en demeurait pas moins une possession directe de l’évêque d’Autun, le second plus important personnage de Bourgogne après le Duc. Le site en lui-même est vraiment intéressant car il se trouve au carrefour de beaucoup de voies locales. De là on peut rapidement rayonner alentour pour porter secours à un site menacé et vice-versa on peut facilement s’y replier.