Il ne faut pas oublier que Léonard de Vinci était homosexuel. Or, il ne s’est jamais séparé de ce tableau. Silvano Vincenti, président du « Comité national pour la valorisation des biens historiques », une association privée italienne d’investigation de l’art, prétend qu’il y a de fortes similitudes entre les traits des visages du Saint Jean Baptiste, de l’ange, et de Monna Lisa. D’après lui, la Joconde serait donc un homme. Le peintre aurait laissé des indices en peignant dans les yeux de la Joconde un minuscule L pour Leonardo et un S pour Salai, « assistant » (doux euphémisme) du peintre qui aurait servi de modèle. Sophie Herfort considère que le portrait de Salai, personnage androgyne aimant porter des bas roses et se féminiser à outrance, et celui de La Joconde posés en calque montrent beaucoup d’analogies.