Vidal-Naquet n’était pas un modèle de méthode, et sa thèse selon laquelle ne pas croire aux chambres à gaz serait équivalent à affirmer que la Lune est en fromage de Roquefort est absurde.

Un exemple d’esprit de faux a été donné par cet historien quand il expliquait, à propos d’un point que les écrits de Faurisson lui avaient permis d’éclaircir : « C’est ce que j’ai écrit, et cru, en 1981, mais, renseignement pris, j’avais tort » (Les Assassins de la mémoire. 1987, p. 202, note 2). Par ailleurs P. V.-N. employait dans cet ouvrage des expressions curieuses, bien propres à autoriser un débat, comme « chambres à gaz imaginaires ou n’ayant pas fonctionné » (p. 203, note 12), ou encore « il y a eu des chambres à gaz imaginaires » (p. 219, note 44).