Mais les spécialistes du domaine écrivent plutôt « supercondensateur » :

Wikipédia a aussi choisi de retenir « supercondensateur ».

De plus, vu que les supercondensateurs sont peu connus, beaucoup pensent qu’il s’agit simplement de gros condensateurs, donc l’écriture « supercondensateur » permet plus facilement d’en faire la distinction qu’avec « super-condensateur ».