Moi, je verrais bien un système où :

— pétition de +x signature = referendum planifié

— préparation du texte du referendum par un jury (10, 20, 30 personnes max) tiré au sort et quelques professionnels (constitutionnalistes, juristes, ..).
   pour éviter des questions piège, prêtant à confusion, orientées, trop vagues, non constitutionnelles, des choix artificiellement limités (excluant, à priori, une réponse possible).

— Referendum 3 à 6 mois après (le temps de laisser retomber l’émotionnel pour que les citoyens puis faire un choix basé sur le rationnel).

— Une assemblée de représentants élus à la proportionnelle intégrale et de hauts fonctionnaires précise les modalités technique de mise en œuvre du choix des citoyens (par exemple, le peuple a décidé, « on ferme les centrales nucléaires », mais à quel rythme, dans quel ordre, avec quelles précautions, et qu’est-ce qu’on fait des déchets ...)